MF o skutkach korygowania faktur do zera

Grzegorz Rodziewicz , oprac.: GR

maj 27, 2026

Zerowanie faktury i wystawienie w jej miejsce nowej nie powoduje czasowego podwójnego opodatkowania tej samej czynności – donosi Dziennik Gazeta Prawna.

Według resortu finansów fakturę wystawioną w Krajowym Systemie e-Faktur należy skorygować „do zera” tylko w razie błędu w NIP nabywcy. W jej miejsce wystawia się nową fakturę ustrukturyzowaną – z poprawnym numerem identyfikacyjnym nabywcy.

Natomiast inne błędy na fakturze powinny być zgodnie z art. 106j ustawy o VAT korygowane poprzez wystawienie faktury korygującej – wyjaśniał wielokrotnie resort finansów.

Nie zawsze w tej sprawie dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej był tego samego zdania co MF. Na przykład w interpretacji z 11 lutego 2026 r. (sygn. 0113-KDIPT1-3.4012.1091.2025.1.JM) stwierdził, że korekta do zera jest konieczna również wtedy, gdy gmina popełniła błąd w polu Podmiot3, czyli w polu przeznaczonym na wskazanie podmiotu, który nie jest nabywcą, tylko faktycznie odbiera fakturę. Gmina uważała, że w takiej sytuacji wystarczy wystawić fakturę korygującą. Dzięki temu odbiorca (samorządowa jednostka organizacyjna) zyska dostęp do faktury w KSeF – argumentowała.

Dyrektor KIS nie zgodził się na taki sposób korekty. Wyjaśnił, że „aby skorygować błąd związany z wystawieniem faktury na podmiot związany z fakturą z jego błędnymi bądź niepełnymi danymi, należy wystawić fakturę korygującą do zera oraz nową fakturę z poprawnymi danymi tego podmiotu”. „Jest to konieczne ze względu na uwarunkowania systemowe” – uzasadnił.

Jakie są skutki zerowania i wystawienia faktury na nowo? W odpowiedzi na pytanie ministerstwo nie zgodziło się z tezą, że w takiej sytuacji przez pewien czas ta sama czynność jest podwójnie opodatkowana i w rezultacie dochodzi do powstania zaległości podatkowej, co oznacza konieczność zapłaty odsetek za zwłokę.

Resort wyjaśnił, że fakturę korygującą „do zera” należy ująć w okresie rozliczeniowym, w którym została ujęta faktura pierwotna zawierająca błędny NIP nabywcy. Należy więc ją ująć za ten sam okres, w którym powstał obowiązek podatkowy dla danej czynności, ze wskazaniem bieżącej daty wystawienia. Przyczyna korekty istniała już bowiem w momencie wystawienia faktury pierwotnej. Nowa faktura nie służy wykazaniu dodatkowej sprzedaży – podkreśliło MF.

To oznacza, że obie faktury (korygująca „do zera” oraz nowa, prawidłowo wystawiona) będą ujęte w tym samym okresie rozliczeniowym. Jeżeli podatnik rozliczył już VAT należny od dokonanej czynności, to wystawienie nowej faktury ustrukturyzowanej (na prawidłowego nabywcę) nie będzie więc skutkować obowiązkiem ponownej zapłaty podatku od tej samej transakcji. Nie powstanie zatem ryzyko zaległości podatkowej i odsetek z tytułu rzekomego braku zapłaty VAT od nowej faktury – podsumowało MF.

Więcej w Dzienniku Gazecie Prawnej z 26 maja 2026 r., autor: Katarzyna Jędrzejewska, oprac.: GR