Podatnik wystąpił z wnioskiem o wydanie interpretacji indywidualnej w zakresie wykładni art. 890 ustawy o VAT. Podatnik wskazał, że będzie posiadał wobec swojego wierzyciela zobowiązanie pieniężne, udokumentowane prawidłowo wystawioną i doręczoną wnioskodawcy fakturą, wystawioną po 4 sierpnia 2012 r., z terminem płatności wynoszącym nie więcej niż 60 dni. Podatnik wskazał, że odliczył VAT naliczony wynikający z tej faktury. Przed upływem terminu płatności zobowiązania wnioskodawca oraz wierzyciel mają zamiar zawrzeć pisemne porozumienie o przedłużeniu terminu płatności. We wniosku o interpretację podatnik zapytał, czy będzie zobowiązany do zmniejszenia nauczonego podatku od towarów i usług, wynikającego z faktury dokumentującej zobowiązanie, z upływem 150 dni od dnia, w którym upłynie pierwotny termin płatności, czy też z upływem 150 dni od dnia, w którym upłynie termin płatności wynikający z porozumienia o przedłużeniu terminu płatności. W ocenie podatnika w opisanej sytuacji będzie on zobowiązany do skorygowania VAT naliczonego dopiero z momentem upływu 150 dni, licząc od przedłużonego przez strony terminu płatności.

Izba Skarbowa w Bydgoszczy w interpretacji z 22 kwietnia 2013 r. (ITP-Pl/443-68a/13/MS) zgodziła się ze stanowiskiem podatnika. Stwierdziła, że w przypadku gdy przed upływem terminu płatności zobowiązania podatnik oraz wierzyciel zawrą pisemne porozumienie o przedłużeniu tego terminu i jednocześnie wnioskodawca ureguluje zobowiązanie w ostatnim dniu terminu przedłużonego porozumieniem, to na podatniku nie będzie ciążył obowiązek dokonania korekty odliczonej kwoty podatku od towarów i usług wynikającej z takiej faktury. W ocenie fiskusa, jeżeli w porozumieniu zostanie zawarta zgodna wola stron co do innego (nowego) terminu zapłaty, to ten termin będzie właściwy do liczenia okresu 150 dni, o którym mowa w art. 89b ustawy o VAT. W takich zatem okolicznościach, w przypadku nieuregulowania należności wynikającej z faktury dokumentującej dostawę towarów lub świadczenie usług na terytorium kraju w terminie 150 dni od dnia upływu terminu płatności określonego w opisanym we wniosku porozumieniu, wnioskodawca będzie zobowiązany do korekty podatku naliczonego, przy jednoczesnym założeniu, że porozumienie to będzie faktycznie obustronną wolą stron transakcji co do ustalenia nowego terminu zapłaty.

Dodatkowo organ podatkowy wskazał, że przepisy podatkowe nie regulują stosunków cywilnoprawnych (zasad zawierania umów cywilnoprawnych, porozumień) ani nie mają wpływu na ich treść, w tym ustalenia dotyczące terminów płatności. Zgodnie z zasadą swobody umów to strony umowy rozstrzygają m.in. zasady rozliczeń z tytułu zawarcia umów cywilnoprawnych.