Faktura, która została jedynie sporządzona, ale nie została wprowadzona do obrotu prawnego (faktura anulowana), nie jest fakturą wystawioną w rozumieniu art. 108 ust. 1 ustawy o VAT i nie stanowi podstawy do zapłaty wykazanego w niej podatku (interpretacja Izby Skarbowej w Poznaniu z 18 września 2009 r., I LPP 1/443-748/09-4/AT).

Natomiast w sytuacji, gdy z anulowanych faktur podatek został przez podatnika rozliczony, organy podatkowe przyjmują, że podatnik (sprzedawca) jest upoważniony do zmniejszenia podatku należnego wykazanego pierwotnie w deklaracji VAT-7 (VAT-7K lub VAT-7D) za okres rozliczeniowy, w którym uwzględniono wartości wynikające z anulowanych faktur. Zmniejszenie to powinno być dokonane poprzez złożenie korekty deklaracji VAT-7 (VAT-7K lub VAT-7D). Należy także skorygować rejestr sprzedaży. Taki pogląd został wyrażony w interpretacji Izby Skarbowej w Warszawie z 25 września 2008 r. (IP-PP2-443-1005/08-2/BM). Podatnik powinien w tym przypadku złożyć wraz z deklaracja podatkową wniosek o stwierdzenie nadpłaty (interpretacja – Izby Skarbowej w Katowicach
z 13 czerwca 2012 r., IBPP2/443-253/12/ICZ).